MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Klebsiella variicola At-22 chromosome

Total Repeats: 127157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013850	GAA	2	6	29	34	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013850	TCT	3	9	52	60	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288932889
3	NC_013850	GCT	3	9	103	111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932889
4	NC_013850	AAT	2	6	113	118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288932889
5	NC_013850	GTA	2	6	140	145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288932889
6	NC_013850	CAC	2	6	146	151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288932889
7	NC_013850	GAA	2	6	173	178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288932889
8	NC_013850	TCT	2	6	211	216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288932889
9	NC_013850	GGT	2	6	236	241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288932889
10	NC_013850	TCT	2	6	250	255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288932889
11	NC_013850	GAA	2	6	260	265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288932889
12	NC_013850	ATG	2	6	279	284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288932889
13	NC_013850	GTA	2	6	296	301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288932889
14	NC_013850	GTA	2	6	377	382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288932889
15	NC_013850	AAT	2	6	407	412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288932889
16	NC_013850	AGC	2	6	421	426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932889
17	NC_013850	CAT	2	6	464	469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288932889
18	NC_013850	GTT	2	6	484	489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288932889
19	NC_013850	TCG	2	6	492	497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932889
20	NC_013850	GCA	2	6	532	537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932889
21	NC_013850	ATG	2	6	585	590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288932889
22	NC_013850	ACGA	2	8	593	600	50 %	0 %	25 %	25 %	288932889
23	NC_013850	GAT	2	6	614	619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288932889
24	NC_013850	CAG	2	6	659	664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932889
25	NC_013850	CAGC	2	8	692	699	25 %	0 %	25 %	50 %	288932889
26	NC_013850	GCG	2	6	724	729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932889
27	NC_013850	ATT	2	6	884	889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288932889
28	NC_013850	GGT	2	6	905	910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288932889
29	NC_013850	CTG	2	6	917	922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932889
30	NC_013850	CAACC	2	10	931	940	40 %	0 %	0 %	60 %	288932889
31	NC_013850	GCC	2	6	1058	1063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288932889
32	NC_013850	GCC	2	6	1181	1186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288932889
33	NC_013850	GCG	2	6	1381	1386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932889
34	NC_013850	AGC	2	6	1443	1448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932889
35	NC_013850	CGG	2	6	1549	1554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932889
36	NC_013850	GCT	2	6	1563	1568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932889
37	NC_013850	CTG	3	9	1589	1597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932889
38	NC_013850	AAC	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288932889
39	NC_013850	GAT	2	6	1661	1666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288932889
40	NC_013850	AAG	2	6	1667	1672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288932889
41	NC_013850	TTGCG	2	10	1674	1683	0 %	40 %	40 %	20 %	288932889
42	NC_013850	CGGGA	2	10	1723	1732	20 %	0 %	60 %	20 %	288932890
43	NC_013850	CAC	2	6	1737	1742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288932890
44	NC_013850	CAAC	2	8	1783	1790	50 %	0 %	0 %	50 %	288932890
45	NC_013850	GGC	2	6	1940	1945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932890
46	NC_013850	GA	3	6	1969	1974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013850	CCA	3	9	2009	2017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_013850	GGC	2	6	2159	2164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932891
49	NC_013850	GCG	2	6	2180	2185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932891
50	NC_013850	GCT	2	6	2201	2206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932891
51	NC_013850	TTA	2	6	2286	2291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288932892
52	NC_013850	ACG	3	9	2325	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932892
53	NC_013850	GAC	2	6	2345	2350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932892
54	NC_013850	TAG	2	6	2357	2362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288932892
55	NC_013850	CGAA	2	8	2479	2486	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013850	TAA	2	6	2535	2540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013850	A	6	6	2593	2598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013850	GCG	2	6	2743	2748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013850	TCCT	2	8	2799	2806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013850	GAA	2	6	2820	2825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013850	TAA	2	6	2907	2912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013850	CAA	2	6	2989	2994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013850	CCG	2	6	3046	3051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288932893
64	NC_013850	GCA	2	6	3068	3073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932893
65	NC_013850	AAT	2	6	3219	3224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288932893
66	NC_013850	CTC	2	6	3234	3239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288932893
67	NC_013850	GGTG	2	8	3281	3288	0 %	25 %	75 %	0 %	288932893
68	NC_013850	AGCC	2	8	3292	3299	25 %	0 %	25 %	50 %	288932893
69	NC_013850	GCG	2	6	3333	3338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932893
70	NC_013850	CGG	2	6	3346	3351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932893
71	NC_013850	CG	4	8	3365	3372	0 %	0 %	50 %	50 %	288932893
72	NC_013850	CGA	2	6	3379	3384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932893
73	NC_013850	TAACGT	2	12	3440	3451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	288932893
74	NC_013850	AC	3	6	3455	3460	50 %	0 %	0 %	50 %	288932893
75	NC_013850	TCG	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932893
76	NC_013850	CG	3	6	3501	3506	0 %	0 %	50 %	50 %	288932893
77	NC_013850	GCG	3	9	3504	3512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932893
78	NC_013850	CGGG	2	8	3532	3539	0 %	0 %	75 %	25 %	288932893
79	NC_013850	GGC	2	6	3564	3569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932893
80	NC_013850	AAC	2	6	3696	3701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288932893
81	NC_013850	CTA	2	6	3722	3727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288932893
82	NC_013850	CTG	2	6	3744	3749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932893
83	NC_013850	TAA	2	6	3773	3778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288932893
84	NC_013850	CTG	2	6	3819	3824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932893
85	NC_013850	CAG	2	6	3834	3839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932893
86	NC_013850	ATC	2	6	3840	3845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288932893
87	NC_013850	AGA	2	6	3884	3889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288932893
88	NC_013850	GCC	2	6	3935	3940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288932893
89	NC_013850	TGA	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288932893
90	NC_013850	A	6	6	3972	3977	100 %	0 %	0 %	0 %	288932893
91	NC_013850	CGTG	2	8	4046	4053	0 %	25 %	50 %	25 %	288932893
92	NC_013850	CGCCAA	2	12	4082	4093	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	288932893
93	NC_013850	CCGG	2	8	4099	4106	0 %	0 %	50 %	50 %	288932893
94	NC_013850	TAC	2	6	4206	4211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288932893
95	NC_013850	CTG	2	6	4230	4235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932893
96	NC_013850	GATGGC	2	12	4274	4285	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	288932893
97	NC_013850	ACCA	2	8	4302	4309	50 %	0 %	0 %	50 %	288932893
98	NC_013850	GGC	2	6	4338	4343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932893
99	NC_013850	ACC	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288932893
100	NC_013850	TGC	2	6	4360	4365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932893
101	NC_013850	GAA	2	6	4395	4400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288932893
102	NC_013850	AGA	2	6	4415	4420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288932893
103	NC_013850	TTA	2	6	4486	4491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288932894
104	NC_013850	GGT	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288932894
105	NC_013850	CTG	2	6	4555	4560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932894
106	NC_013850	TGG	2	6	4616	4621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288932894
107	NC_013850	CG	3	6	4622	4627	0 %	0 %	50 %	50 %	288932894
108	NC_013850	CTGC	2	8	4789	4796	0 %	25 %	25 %	50 %	288932894
109	NC_013850	TAC	2	6	4915	4920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288932894
110	NC_013850	CGG	2	6	5082	5087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932894
111	NC_013850	GCA	2	6	5114	5119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932894
112	NC_013850	CGC	2	6	5191	5196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288932894
113	NC_013850	GCTG	2	8	5230	5237	0 %	25 %	50 %	25 %	288932894
114	NC_013850	CG	3	6	5263	5268	0 %	0 %	50 %	50 %	288932894
115	NC_013850	AAC	2	6	5341	5346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288932894
116	NC_013850	GGAGAT	2	12	5397	5408	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	288932894
117	NC_013850	CTG	2	6	5473	5478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932894
118	NC_013850	CCG	2	6	5525	5530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288932894
119	NC_013850	GTC	2	6	5536	5541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932894
120	NC_013850	GC	3	6	5646	5651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013850	TCA	2	6	5725	5730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288932895
122	NC_013850	CTAT	2	8	5830	5837	25 %	50 %	0 %	25 %	288932895
123	NC_013850	AGG	2	6	5899	5904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288932895
124	NC_013850	GCC	2	6	5920	5925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288932895
125	NC_013850	TTTAC	2	10	6069	6078	20 %	60 %	0 %	20 %	288932895
126	NC_013850	CGG	2	6	6083	6088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932895
127	NC_013850	AGA	2	6	6099	6104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288932895
128	NC_013850	TTC	2	6	6144	6149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288932895
129	NC_013850	AGC	2	6	6181	6186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932895
130	NC_013850	CGC	2	6	6191	6196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288932895
131	NC_013850	GTCAG	2	10	6202	6211	20 %	20 %	40 %	20 %	288932895
132	NC_013850	TCG	2	6	6301	6306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932895
133	NC_013850	CG	3	6	6514	6519	0 %	0 %	50 %	50 %	288932895
134	NC_013850	CTG	2	6	6531	6536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932895
135	NC_013850	GCGG	2	8	6583	6590	0 %	0 %	75 %	25 %	288932895
136	NC_013850	GAT	2	6	6609	6614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288932895
137	NC_013850	TGA	2	6	6629	6634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288932895
138	NC_013850	CGC	2	6	6639	6644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288932895
139	NC_013850	GCC	2	6	6658	6663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288932895
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141	NC_013850	GTAT	2	8	6878	6885	25 %	50 %	25 %	0 %	288932896
142	NC_013850	CAC	2	6	6916	6921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288932896
143	NC_013850	CGA	2	6	6951	6956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932896
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147	NC_013850	CGG	2	6	7143	7148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932896
148	NC_013850	GGT	2	6	7170	7175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288932896
149	NC_013850	AGCTGG	2	12	7193	7204	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	288932896
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153	NC_013850	CAA	2	6	7494	7499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288932896
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160	NC_013850	AAG	2	6	7703	7708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288932896
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162	NC_013850	CGA	2	6	7743	7748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932896
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164	NC_013850	CAG	2	6	7858	7863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932896
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167	NC_013850	ATT	2	6	7930	7935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288932896
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174	NC_013850	CAT	4	12	8283	8294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288932896
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176	NC_013850	CTT	2	6	8343	8348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288932896
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249	NC_013850	CTG	3	9	11488	11496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932899
250	NC_013850	GGCT	2	8	11551	11558	0 %	25 %	50 %	25 %	288932899
251	NC_013850	GCA	2	6	11559	11564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932899
252	NC_013850	GCTGGG	2	12	11643	11654	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	288932899
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256	NC_013850	TAC	2	6	11845	11850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288932899
257	NC_013850	GGT	2	6	11972	11977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288932899
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263	NC_013850	CGT	2	6	12360	12365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932899
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265	NC_013850	GGC	2	6	12401	12406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932899
266	NC_013850	GCTG	2	8	12473	12480	0 %	25 %	50 %	25 %	288932899
267	NC_013850	CGG	2	6	12486	12491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932899
268	NC_013850	GCA	2	6	12557	12562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932899
269	NC_013850	CG	3	6	12621	12626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
270	NC_013850	ACC	2	6	12703	12708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288932900
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272	NC_013850	GC	4	8	12856	12863	0 %	0 %	50 %	50 %	288932900
273	NC_013850	GTG	2	6	12870	12875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288932900
274	NC_013850	AGC	2	6	12922	12927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932900
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278	NC_013850	GC	3	6	13036	13041	0 %	0 %	50 %	50 %	288932900
279	NC_013850	GCG	2	6	13045	13050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932900
280	NC_013850	TGC	2	6	13114	13119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932900
281	NC_013850	GGC	2	6	13160	13165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932900
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286	NC_013850	AGC	2	6	13411	13416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932900
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298	NC_013850	GGA	2	6	13724	13729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288932900
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302	NC_013850	CA	3	6	13883	13888	50 %	0 %	0 %	50 %	288932900
303	NC_013850	GGCA	2	8	13909	13916	25 %	0 %	50 %	25 %	288932901
304	NC_013850	T	6	6	13965	13970	0 %	100 %	0 %	0 %	288932901
305	NC_013850	TGATT	2	10	13978	13987	20 %	60 %	20 %	0 %	288932901
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310	NC_013850	GTC	2	6	14220	14225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932901
311	NC_013850	TTC	2	6	14238	14243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
312	NC_013850	TCG	2	6	14246	14251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
313	NC_013850	CTC	2	6	14355	14360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
314	NC_013850	C	6	6	14360	14365	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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316	NC_013850	A	7	7	14392	14398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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324	NC_013850	ACCT	2	8	14798	14805	25 %	25 %	0 %	50 %	288932902
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383	NC_013850	TGAC	2	8	17163	17170	25 %	25 %	25 %	25 %	288932904
384	NC_013850	CAA	2	6	17191	17196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288932904
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394	NC_013850	GC	3	6	17468	17473	0 %	0 %	50 %	50 %	288932905
395	NC_013850	GCT	2	6	17476	17481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288932905
396	NC_013850	TGA	3	9	17521	17529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288932905
397	NC_013850	TCC	2	6	17619	17624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288932905
398	NC_013850	CCG	2	6	17657	17662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288932905
399	NC_013850	TCA	2	6	17679	17684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288932905
400	NC_013850	GCA	2	6	17695	17700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932905
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402	NC_013850	CAC	2	6	17753	17758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288932905
403	NC_013850	GCA	2	6	17776	17781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288932905
404	NC_013850	GCCAG	2	10	17787	17796	20 %	0 %	40 %	40 %	288932905
405	NC_013850	ATG	2	6	17813	17818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288932905
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416	NC_013850	TAAT	2	8	18103	18110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
417	NC_013850	TCAT	2	8	18113	18120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
418	NC_013850	GAC	2	6	18174	18179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
419	NC_013850	TGT	2	6	18231	18236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
420	NC_013850	AAG	2	6	18283	18288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
421	NC_013850	GTT	2	6	18305	18310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
422	NC_013850	GGC	2	6	18351	18356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932906
423	NC_013850	TGT	2	6	18376	18381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288932906
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495	NC_013850	TTC	2	6	21304	21309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
496	NC_013850	AACG	2	8	21420	21427	50 %	0 %	25 %	25 %	288932908
497	NC_013850	CGC	2	6	21467	21472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288932908
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500	NC_013850	CGG	2	6	21557	21562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288932908

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